Ученые Башкирского государственного медицинского университета разработали тест-систему для быстрого и недорогого определения количества бактерии Akkermansia muciniphila в организме человека. Эта микрокультура, неофициально именуемая «бактерией стройности», является основным маркером здорового метаболизма.
Бактерия обитает в кишечнике здорового человека и составляет от одного до четырех процентов от всей микробиоты. Дефицит этой бактерии напрямую связан с развитием ожирения, сахарного диабета второго типа и воспалительных заболеваний кишечника, а избыток может привести к развитию онкологических заболеваний.
До недавнего времени точное количественное определение данного вида бактерии в клинических образцах для ученых представляло сложную задачу. Раньше Akkermansia, как строгий анаэроб, была крайне сложна для идентификации. Единственным достоверным способом считалось полногеномное секвенирование — длительный и дорогостоящий процесс. Для рутинной диагностики это нецелесообразно.
Команда ученых БГМУ Минздрава России вышла за рамки существующих аналогов. Если ранее исследования позволяли подобрать праймеры только к роду бактерий, то башкирские ученые разработали нуклеотидные праймеры и зонды для вида Akkermansia muciniphila.
«Мы не просто нашли бактерию, мы нашли применение этому знанию. Тест-система поможет врачам управлять микробиомом для профилактики целого спектра социально значимых заболеваний», — отметил ректор БГМУ Минздрава России, академик РАН, профессор Валентин Павлов.
Новая тест-система на основе полимеразной цепной реакции работает по принципу, схожему с принципом действия тестов на коронавирус, но нацелена на выявление конкретной бактерии. Это позволяет проводить как качественный, так и количественный анализ.
Внедрение разработки открывает эру доступной персонализированной диагностики. Тест-система БГМУ Минздрава России значительно дешевле секвенирования, что делает мониторинг состояния микробиоты доступным для клиник и научных центров.
Разработка имеет двойное назначение. Во-первых, это объективный мониторинг эффективности терапии для пациентов с метаболическими нарушениями. Во-вторых, тест может использоваться фармацевтическими компаниями для проверки наличия и количества штамма в пробиотических препаратах перед регистрацией и выпуском на рынок.
Проект реализовывался в рамках программы Минобрнауки России «Приоритет-2030» (нацпроект «Молодежь и дети»).
